Die Zukunftsakademie wird von den Geschäftsführern Frau Sabine Palinkas, Rektorin der Bergschule Heidenheim, und Herrn Erich Ott, Oberstudiendirektor i. R., für den Elementar- und Primarbereich geleitet.

Zu ihren Aufgaben gehören insbesondere die Organisation und Koordination des Kursangebotes, Gewinnung von internen und externen Lehrkräften, Ausschreibung der Kurse, die Entscheidung über die Teilnahme der von den Schulen und Kindergärten empfohlenen Kindern an den gewünschten Kursen der Zukunftsakademie, Einteilung der Kinder in die Kurse sowie die Mitwirkung an Fortbildungen.